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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
广西建设“预制菜产业联盟”龙头 将有效供给粤港澳大湾区******
中新网南宁12月30日电(黄令妍 黄赟)广西农垦集团党委副书记、总经理谭良良30日在预制菜新品发布会上介绍，将尽快建设好“广西预制菜产业联盟”产业发展龙头，着力构建富有竞争力的产业体系，打造预制食品产业发展原料生产、产品研发、生产加工、仓储物流、市场交易五个中心，有效供给粤港澳大湾区乃至全国市场。
广西是中国重要的“果园子”“糖罐子”“菜篮子”“鱼塘子”，水果、秋冬菜、优质鸡等产业规模稳居全国第一，渔业经济总产值突破千亿元大关。首批由30家单位发起的“广西预制菜产业联盟”今年8月成立，将抢占产业发展“新风口”。
图为预制菜品展示。 黄令妍 摄近年来，广西打造了诸如“桂字号”“广西好嘢”“桂垦良品”“助农珍优”等一批具有较强影响力的区域农产品品牌，培育了甘家界柠檬鸭、柳州螺蛳粉、桂林豆腐乳、阳朔啤酒鱼、陆川扣肉、巴马香猪、合浦黄记月饼等一批桂味佳肴；建成了柳州螺蛳粉小镇、桂林米粉产业园、北海海洋产业园、南宁市农业高新区等一批预制菜产业园区；形成了广西农垦集团、北投集团、农投集团等一批领衔预制菜产业发展的行业龙头，进一步夯实预制菜产业基础。
据介绍，创建于1951年的广西农垦集团建设有糖料蔗、生猪、水果、蔬菜、茶叶、奶牛等十大基地，生猪产业在良种繁育等领域掌握核心科技，供港活猪占香港市场20%以上。充分依托各类原料基地优势，结合广西轻工院的研发技术，广西农垦集团已自主研发推出扣肉、牛腩煲、螺蛳鸭脚煲、乳鸽、油茶等各式预制菜产品。该集团将大力研发新品、不断完善渠道、提高供应水平、适应市场需要，建成有效供给全广西、粤港澳大湾区乃至全国的预制菜头部企业。
图为预制菜品展示。 黄令妍 摄广西毗邻东盟，是预制菜产业国际化的理想平台。2022中国—东盟预制菜产业发展大会9月在广西南宁召开，来自国内外的350多家企业参会，现场签订预制菜产业投资合作项目38个，总投资200.5亿元。广西还将出台预制菜产业系列指导文件，充分发挥产业联盟引导作用，切实推动形成空间布局合理、集聚效应明显、产品种类鲜明的预制菜产业集群。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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